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求学和研究方法

qPCR实验操作和文章发表指南:MIQE

现在如何操作实时定量PCR (quantitative real-time PCR, qPCR)实验和和解释其结果缺少一个共识。在很多发表的文章中缺乏足够的qPCR实验细节,这了妨碍了我们评估结果质量,或者让我们难以根据文章重复实验。正如科研动力曾经提到过Oncogene撤回一篇2010年的文章一事,如果杂志本身按照qPCR标准审查稿件,可能也不会发生这事儿。 由此可见有关qPCR制定一个实验和发表标准是多么的重要。不过幸好,Clin Chem. 2008年发表一篇文章,就是一群qPCR大牛经过商讨制定的qPCR实 […]

什么是P-hacking及其在科研中的危害

我们在统计时经常用到P值,一般认为P≦0.05有统计学意义。但是现在很多统计学家并不是这样认为,对于P值的滥用和误用进行了苛刻的批评。因此出现了一个新词:P-hacking。什么是P-hacking?P-hacking在科研研究中有什么危害? 什么是P-hacking P-hacking 最早应该是美国宾夕法尼亚大学的Simmons和他的团队提出来的[1, 2]。 P-hacking 按照字面的意思来看是「P值黑客],但是实际上的意思科研动力认为是「P值篡改」或者「P值操纵」。这可能是在线都市词典收录的第一个统计词 […]

如何通过外文文献一句话找到原文

有时候我们经常看到某篇文献的一句话,可能是在其他论文或者网站中引用的,可是却没有给出出处,如何通过这句话才能找到原文呢?或者更有甚者,有的文章只给出了其中的一个作者或者其他一些信息,如何通过这些信息找到原始文献出处呢?科研动力本文就两个例子说明一下,希望对大家有所帮助。 通过一句话找到原始文献出处 首先看看如何通过一句话找到原始文献的出处。其实这个问题是看到丁香园某个网友问的,那我就借用他给出的这句话找找原文。 这位网友给出的这句话是这样的 it is therefore not too surprising th […]

P值小于等于0.05是否真有统计学意义

在科技论文中少不了统计,而统计中又常常避免不了值,一般认为P≤0.05或者P≤0.01有显著性差异,我们的研究有统计意义。事实是真的这样吗?其实有时如果P≤0.05也并非真正有统计意义。以下是科研动力译自Nature的一篇文章:Scientific method: Statistical errors,相信您看完之后会有些许收获。 美国弗吉尼亚大学的 Matt Motyl 于2010进行了一项近2000人的研究他发现政治温和派似乎比左翼或者右翼人士看到更多的灰度。这个结果太有意思了,而且 Motyl 很坚信这个结果 […]

科研论文写作FAQs

科研动力也写过或者转载过一些关于论文写作和英文写作的文章了,在此做一总结索引,方便查找。 置顶推荐 除了影响因子 还有哪些指标可以评价论文的价值 ResearchGate科研人员自己的FaceBook 利用Plum Metrics评价系统了解论文的关注度分享情况 利用Altmetric评价系统了解论文的关注度分享情况 1. 论文写作 毕业论文的各种写法 论文中的图表制作方法和技巧 SCI论文并没有想像中的难写,浅谈发表SCI论文的一些小技巧 SCI论文各部分撰写方法及注意事项 视频: 如何撰写科技论文-How to […]

使用cBio Cancer Genomics Portal综合分析癌症基因和临床资料

cBio Cancer Genomics Portal提供了研究分析癌症基因数据的可视化工具,cBioPortal可以帮助癌症组织和细胞学研究得到的分子学数据认识和理解遗传、表观遗传、基因表达和蛋白质组学。通过自定义数据的交互界面要以主研究人员探求研究基因改变和临床之间的联系。cBioPortal提供了图形化的结果,使复杂的癌症基因组学资料更易理解和接受,而不需要特殊的生物信息学知识。 cBio Cancer Genomics Portal简介 大样本癌症基因组计划,如如癌症基因图谱(Cancer  Genome  […]

cBio Cancer Genomics Portal:研究多维癌症基因组学的开放平台

cBio Cancer Genomics Portal是一个多维癌症基因组学的开放平台,迄今提供20项肿瘤研究的5000余种肿瘤样本的免费数据。cBio Cancer Genomics Portal明显减少了复杂的基因组数据和肿瘤研究者希望快速、直观和高质量的大型肿瘤基因研究中得到研究分子特性和临床特征之间的距离,并且授权研究人员把这些丰富的数据研究出生物学的特点和应用于临床。 cBio Cancer Genomics Portal简介 随着基因测序成本的降低,以及一些国家和国际组织的努力,如癌症基因图谱(Canc […]

除了影响因子 还有哪些指标可以评价论文的价值

除了影响因子,还有哪些指标可以评价论文的价值?一提起论文价值,恐怕首先想到的是影响因子。尤其是在中国,影响因子对于科研人员和工作者真是命根,晋级,升迁,申请基金,评奖等等无不与影响因子有关。但是除了影响因子,还有许多其它的评价论文价值的方法。本文就介绍一下常见和新兴的评价论文价值的指标。 评价一个论文价值,无非从量化和质化两个方面来评价,或者期刊和论文的角度来评价。下面提到的指标,有的是从量化,有的是从质化,有的是从期刊角度,有的是从文章角度。 影响因子 影响因子确切说是针对期刊的,而并非直接针对论文的。 影响因子 […]

爱情与大米

曾经有一首歌典唱的好:「我爱你,爱着你,就像老鼠爱大米」。大米与爱情真的有联系吗?没想到杨臣刚当时的一首「老鼠爱大米」真是一语中的,爱情和大米之间还真的有联系。因为有人研究了,而且还发表在了国际最最著名杂志之一的科学杂志上。爱情与大米,看似两个牛马不相及的命题,被一篇最近发表于Science的文章给联系了起来。 爱情与大米 Science 2014年5月9日发表的一期中有一篇文章,Large-Scale Psychological Differences Within China Explained by Rice […]

ResearchGate科研人员自己的FaceBook

ResearchGate科研人员自己的FaceBook。如果想了解自己发表文章的引用情况,经典的可能就是Google Scholar了。但是Google Scholar只能提供引用次数简单数据,现在都早已是Web 2.0时代,社会化分享和交友是主流。因此,除了引用之外,我们还想了解一下文章分享情况,甚至下载、阅读、报道等等。如此谷歌学术搜索就显得无能为力了。ResearchGate就是因此而生。本文简要介绍一下ResearchGate及其使用方法。 ResearchGate简介 ResearchGate是由医学家I […]